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「ユビキチンコード」解明へ向けたポリユビキチン化基質の網羅的同定

研究課題

研究課題/領域番号 19K22408
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
研究機関北海道大学

研究代表者

渡部 昌  北海道大学, 医学研究院, 講師 (10632424)

研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2021年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2019年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードユビキチン / ポリユビキチン鎖 / プローブ / プロテオミクス
研究開始時の研究の概要

ユビキチンは、自身の分子内に7個存在するリジンおよびアミノ末端のメチオニンを介して多彩なポリユビキチン鎖を形成することができる。鎖の種類によって付加される標的タンパク質に異なる結果をもたらし、その修飾と機能の関係性は「ユビキチンコード」とも呼称されている。基質と付加する鎖の種類の決定はユビキチンリガーゼ(E3)が重要な役割を果たす。したがってポリユビキチン鎖の機能を解明するためには「どのE3が」、「どの基質に」、「どのポリユビキチン鎖を付加」するのかを明らかにする必要があるが、体系的・網羅的な研究は未だ行われていない。本研究ではこの3者の関係を明らかにし、ポリユビキチン鎖の機能解明を目指す。

研究成果の概要

ユビキチンによるタンパク質の可逆的修飾は、様々な生命現象を支える重要な翻訳後修飾の一つであり、特に近年、自身の分子内に7個存在するリジン残基とアミノ末端のメチオニンを介した多彩なポリユビキチン鎖と、その機能との関係性の解明に焦点があたっている。本研究では、ポリユビキチン鎖を効率よく抽出するプローブを複数開発し、そのポリユビキチン鎖特異性の検証を行った。その結果、バリエーションに富んだ特異性を保持する複数のプローブを得た。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、ポリユビキチン鎖を効率よく抽出するプローブの開発を行った。この技術をさらに発展させることで、個々のポリユビキチン鎖の効率的な抽出が可能となり、さらに個々のユビキチン付加酵素(ユビキチンリガーゼ)がどの基質に対してどのポリユビキチン鎖を付加しているのかという情報を先入観なく網羅的に同定することが可能となるものと思われる。多彩なポリユビキチン鎖を介した未解明の制御機構の発見に結びつくことが期待できる。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 3件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Fluticasone Propionate Suppresses Poly(I:C)-Induced ACE2 in Primary Human Nasal Epithelial Cells2021

    • 著者名/発表者名
      Nakazono Akira、Nakamaru Yuji、Ramezanpour Mahnaz、Kondo Takeshi、Watanabe Masashi、Hatakeyama Shigetsugu、Kimura Shogo、Honma Aya、Wormald P. J.、Vreugde Sarah、Suzuki Masanobu、Homma Akihiro
    • 雑誌名

      Frontiers in Cellular and Infection Microbiology

      巻: 11 ページ: 655666-655666

    • DOI

      10.3389/fcimb.2021.655666

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Loss of FAM83H promotes cell migration and invasion in cutaneous squamous cell carcinoma via impaired keratin distribution2021

    • 著者名/発表者名
      Tokuchi Keiko、Kitamura Shinya、Maeda Takuya、Watanabe Masashi、Hatakeyama Shigetsugu、Kano Satoshi、Tanaka Shinya、Ujiie Hideyuki、Yanagi Teruki
    • 雑誌名

      Journal of Dermatological Science

      巻: 104 号: 2 ページ: 112-121

    • DOI

      10.1016/j.jdermsci.2021.09.007

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of intracellular zinc in molecular and cellular function in allergic inflammatory diseases2021

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Masanobu、Suzuki Takayoshi、Watanabe Masashi、Hatakeyama Shigetsugu、Kimura Shogo、Nakazono Akira、Honma Aya、Nakamaru Yuji、Vreugde Sarah、Homma Akihiro
    • 雑誌名

      Allergology International

      巻: 70 号: 2 ページ: 190-200

    • DOI

      10.1016/j.alit.2020.09.007

    • NAID

      130008024307

    • ISSN
      1323-8930, 1440-1592
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] A substrate-trapping strategy to find E3 ubiquitin ligase substrates identifies Parkin and TRIM28 targets2020

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Masashi、Saeki Yasushi、Takahashi Hidehisa、Ohtake Fumiaki、Yoshida Yukiko、Kasuga Yusuke、Kondo Takeshi、Yaguchi Hiroaki、Suzuki Masanobu、Ishida Hiroki、Tanaka Keiji、Hatakeyama Shigetsugu
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 3 号: 1 ページ: 592-592

    • DOI

      10.1038/s42003-020-01328-y

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The role of Mediator and Little Elongation Complex in transcription termination2020

    • 著者名/発表者名
      Takahashi H, Ranjan A, Chen S, Suzuki H, Shibata M, Hirose T, Hirose H, Sasaki K, Abe R, Chen K, He Y, Zhang Y, Takigawa I, Tsukiyama T, Watanabe M, Fujii S, Iida M, Yamamoto J, Yamaguchi Y, Suzuki Y, Matsumoto M, Nakayama KI, Washburn P, Saraf A, Florens L, Sato S, Tomomori-Sato C, Conaway RC, Conaway JW, Hatakeyama S
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 1-20

    • DOI

      10.1038/s41467-020-14849-1

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] A substrate-trapping strategy to find E3 ubiquitin ligase substrates.2021

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Masashi
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on the Ubiquitin Family
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] TRIM28はサイクリンA2のユビキチン化を介しS期への早期進行を抑制する2021

    • 著者名/発表者名
      渡部 昌, 畠山鎮次
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 基質トラップ戦略によるユビキチンリガーゼParkin、TRIM28の網羅的な基質同定2021

    • 著者名/発表者名
      渡部 昌, 畠山鎮次
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ユビキチン様修飾分子UFM1によるロイコトリエン生合成の制御2020

    • 著者名/発表者名
      渡部 昌
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 自然免疫シグナルに関わるユビキチンリガーゼ群の網羅的な基質同定と解析2019

    • 著者名/発表者名
      渡部 昌
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-07-04   更新日: 2025-01-30  

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